ตามจำนวนอะตอมไฮโดรเจนที่ถูกแทนที่ เอมีนจะถูกจำแนกตามลำดับต่อไปนี้: เอมีนปฐมภูมิ (RNH2), เอมีนทุติยภูมิ (R2NH), เอมีนตติยภูมิ (R3N) และเกลือแอมโมเนียมควอเทอร์นารี (R4N+X-) ตัวอย่างประกอบด้วยเมทิลเอมีน (CH3NH2), อะนิลีน (C6H5NH2), เอทิลีนไดเอมีน (H2NCH2CH2NH2), ไดไอโซโพรพิลเอมีน ([(CH3)2CH]2NH), ไตรเอทาโนลามีน (HOCH2CH2)3N และเตตระบิวทิลแลมโมเนียมโบรไมด์ (CH3CH2CH2CH2)4N+Br- แอมโมเนียมไฮดรอกไซด์ทดแทนเตตระไฮดรอกซีหรือเกลือแอมโมเนียมเรียกว่าควอเทอร์นารีแอมโมเนียมไฮดรอกไซด์หรือเกลือแอมโมเนียมควอเทอร์นารี [1] NH4+แอมโมเนียม R4NOH ควอเตอร์นารีแอมโมเนียมไฮดรอกไซด์ R4NX เกลือควอเตอร์นารีแอมโมเนียม
ตามกลุ่มไฮโดรคาร์บอนประเภทต่างๆ ที่ยึดติดกับอะตอมไนโตรเจนในโมเลกุลเอมีน เอมีนสามารถแบ่งออกเป็นเอมีนอะลิฟาติกและเอมีนอะโรมาติก หากโมเลกุลเอมีนประกอบด้วยหมู่อะมิโนตั้งแต่สองหมู่ขึ้นไป (-NH2) ก็สามารถจำแนกได้เป็นไดเอมีนและไตรเอมีนตามจำนวนหมู่อะมิโน
